Laurent Marsan #84 Xom Chùa, ngo 12 Dang Thai Mai, Tây Ho district Hanoi, Vietnam Tel         +84(0)912202751 e-mail    lau.NOM_DE_FAMILLE AT gmail.com

 

FORMATION

• Docteur en Informatique de l'Université de Marne-la-Vallée, depuis le 8 Avril 2002.
     Sujet :"Inférence de motifs structurés : Algorithmes et outils appliqués à la détection de sites de fixation dans des séquences génomiques".
     Direction : M. Crochemore (Institut Gaspard Monge) et M.-F. Sagot (INRIA Rhône-Alpes)

• DEA Informatique Fondamentale et Applications à l'UMLV (1997/98)

• Maîtrise d'Informatique à l'UMLV (1995/96)

 

EXPERIENCE PROFESSIONNELLE

• Depuis Septembre 2003 : Maître de conférences en Informatique à l'IUT de Vélizy. Rattaché au PRISM - Université de Versailles-St Quentin.

o        Recherche et développement d’algorithmes combinatoires de détection d’incompatibilités dans les mutations observées sur le génome de HIV.

o        Enseignements en algorithmique du texte appliquée à la bio-informatique (Master Recherche Informatique), initiation à l’algorithmique, langage C, XML/PHP, systèmes d’exploitation (DUT Informatique 1^ère et 2^ème années), gestion de projets en équipe.

o        Gestion du séminaire d’équipe, administration du site d’équipe.

• Septembre 2001 - Août 2003 : Attaché Temporaire d’Enseignement Rechercheà l'UMLV (IUT et université).

o        Recherche et développement d’un algorithme combinatoire de mise en évidence de sites spécifiques dans des séquences génomiques.

o        Enseignements en algorithmique et JAVA (Ecole Ingénieurs 2000), UNIX (Master Pro Technologies et Techniques des Télécommunications), réseaux sous Windows et Linux (DUT Systèmes et réseaux de communication).

• Septembre 1998 - Août 2001 : Moniteur à l'UMLV.

o        Enseignements en algorithmique et structures de données (Licence Informatique), Shell UNIX et langage C (DESS Electronique), bureautique, algorithmique, langage C avancé, langages Web (DEUG).

• Mars-Septembre 1998 : Stagiaire de DEA à l'Institut Pasteur de Paris, au Service d'Informatique Scientifique.

o        Recherche et développement d'un outil d'inférence de motifs répétés dans des séquences d'ADN.

• Mai-Juillet 1996 : Stagiaire de Maîtrise à l'Institut Gaspard Monge.

o        Participation à la recherche et au développement d'un modèle statistique d'évolution des gènes.

 

PUBLICATIONS

• Conférences internationales (comité de lecture)

  • N. Pisanti, A. Carvalho, L. Marsan, M.-F. Sagot
    RISOTTO: Fast extraction of motifs with mismatches
    Proc. of Latin American Theoretical INformatics (LATIN), Springer LNCS 3887, pages 757-768, 2006.
  • L. Marsan and M.-F. Sagot
    Extracting structured motifs using a suffix tree - Algorithms and application to consensus identification
    in S. Minoru and R. Shamir (eds.), RECOMB, Tokyo, Japon, Proc. of the 4th Annual International Conference on Computational Molecular Biology, p210-219, ACM Press, 2000.
    

• Revues internationales (comité de lecture)

  • S. Brouillet, T. Valère, E. Ollivier, L. Marsan, A. Vanet
    Co-lethality studied as an asset against viral drug escape: the HIV protease case
    Biology Direct 2010, 5:40
  • L. Marsan and M.-F. Sagot.
    Algorithms for extracting structured motifs using a suffix tree with application to promoter and regulatory site consensus identification
    Journal of Computational Biology, 7:345-360, 2000.
  • A. Vanet, L. Marsan, and M.-F. Sagot.
    Promoter sequences and algorithmical methods for identifying them.
    Research in Microbiology 150: 779-799. 1999.
  • A. Vanet, L. Marsan, A. Labigne, and M.-F. Sagot.
    Inferring regulatory elements from a whole genome. An analysis of the sigma 80 family of promoter signals.
    Journal of Molecular Biology 297(2): 335-353, 2000.
  • D. Arquès, J.-P. Fallot, L. Marsan and C. Michel.
    An evolutionary analytical model of a complementary circular code.
    Biosystems 49(2): 83-103, 1999.

• Posters

  • A. Vanet, E. Ollivier, L. Marsan and S. Brouillet.
    HIV database.
    JOBIM'05, Lyon, France, 2005.
  • S. Brouillet, E. Ollivier, L. Marsan and A. Vanet.
    HIV : from structure to therapeutic target.
    JOBIM'05, Lyon, France, 2005.
  • E. Ollivier , S. Brouillet, L. Marsan and A. Vanet.
    HIV : a medicine for one day, a medicine forever.
    JOBIM'05, Lyon, France, 2005.
  • L. Marsan, S. Brouillet, E. Ollivier and A. Vanet.
    HIV : towards stable multi-therapies.
    JOBIM'05, Lyon, France, 2005.

• Brevets

  • A. Vanet, S. Brouillet, E. Ollivier and L. Marsan (2006).
    Nouvelle méthode statistique et résultats bioinformatiques pour l'identification de sites de fixation de médicaments contre les virus à haut taux de mutabilité.
    En cours.
  • A. Vanet, S. Brouillet, L. Marsan and E. Ollivier (2006).
    Method for identifying motifs and/or combinations of motifs having a boolean state of predetermined mutation in a set of sequences and its applications.
    Continuation In Part (CIP) n°13052-US-02 du brevet n° 10/734023 (CNRS, 2006)

 

COMPETENCES

 

Algorithmique :	Algorithmique du texte, des graphes/arbres, structures de données, optimisation combinatoire, hachage, automates, transducteurs.
Langages et outils de développement :	C/C++, JAVA, HTML, XML, PHP, PERL, Shells Unix.
Systèmes d'exploitation :	Windows (XP/2000 Server), Unix (HP-UX, Linux).

 

 

DIVERS

• Langues étrangères :

o        anglais courant et technique : lu, écrit, parlé, niveau TOEFL.

o        allemand, italien : notions.

o        vietnamien : en cours d’apprentissage.

• Permis A et B.

LOISIRS

        Photographie, guitare, escalade.